Уровни изучения биологической антропологии соответствуют практически всем уровням организации человека. Специальные разделы антропологии посвящены исследованию генетических, молекулярных, физиологических систем признаков, исследуется морфология на уровне органов и их систем, на уровне индивида. Изменчивость этих характеристик исследуется на надындивидуальном - популяционном уровне. Иногда отдельно выделяется расовый уровень.
